Средство «Септустин» представляет собой жидкость прозрачную светло-фиолетового, цвета со слабым специфическим запахом. В состав средства в качестве действующего вещества входит 10% алкилдиметилбензиламмония хлорид (бензалкониум хлорид), а также неионогенное поверхностно-активное вещество, натрий гидрокарбонат и изопропиловый спирт (10%).
Средство обладает антимикробным действием в отношении бактерий (включая микобактерии туберкулеза), вирусов (тест-вирус-полиомиелит), грибов рода Кандида, дерматофитов, плесневых грибов.